要求海关对其知识产权实施保护的权利人，将其知识产权的法律状况、有关货物的情况、知识产权合法使用情况和侵权货物进出口情况以书面形式通知海关总署，以便海关在对进出口货物的监管过程中主动对有关知识产权实施保护。根据2003年12月修订的《知识产权海关保护条例》，知识产权备案不再是海关对知识产权实施保护的前提，未进行知识产权备案的权利人仍然有权向口岸海关申请扣留进出口的侵权货物。但是，事先是否进行知识产权备案，在实践中有很大的差异。
知识产权海关备案期限为10年，不足10年按照该知识产权权利剩余有效期计算，可续展，实践中是按照7年来操作的。知识产权海关备案的续展为在有效期前六个月提出申请，15天内审批。知识产权海关备案变更：知识产权人的名称、地址、知识产权许可使用情况、载有知识产权产品情况发生更变、代理人情况变更的，核准变更后10天内办理。
为减少知识产权权利人申请时间和提高海关总署审核备案申请的效率，除特殊情况外，目前知识产权海关保护备案申请都应当通过“知识产权海关保护备案申请系统”提交。所以，备案申请人在提交备案申请前首先要注册为系统用户。系统用户应当以知识产权权利人的名义进行注册，填写必要的用户信息，以获取系统账号和密码。注册用户登录备案申请系统后，在申请新备案窗口内填写申请备案的知识产权和其他相关信息。
根据《知识产权海关保护条例》的规定，海关总署应当在自收到申请人提交的全部申请文件之日起30个工作日内将做出核准或者驳回申请的决定。海关总署核准或者驳回备案申请，都应当向申请人发出书面通知。海关总署驳回申请的，不退还原申请文件。